Одного не могу понять. То есть гильдия уже восстановлена, а Нацу все с теми же силами что-ли? В последней серии 2 сезон он от своей СИЛИЩИ плавил арену, а в фильме он остался Нацу без прокачки! Странно, очень странно

Фильм это филлер, он к оригиналу не имеет никакого отношения, это не события до/после того или другого сезона, это просто отдельно придуманная история.
Ну а Люси получает способности с тех пор, как в конце 2 сезона осталась без своего первого духа.. Шарли форму меняет +- с тех же пор, это её магия которую открыла примерно в тех событиях... Ну а Гарыныч.. misha2481, он не юзал никакой формы дракона против Зерефа, он ток силу использовал

События в фильме происходят до начала 3-го сезона.(Небольшой спойлер) Я читал мангу и там был момент, где Нацу смог так сказать обуздать свою форму дракона(частично) и использовал её во время сражения с Зерефом. Так же на это указывает конец самого фильма, где нам показывают Зерефа.

Например: Люси с призывом духа , получает его способность; Шарли меняет свою форму и т.п.