Это догадка, но если вспомнить всё аниме, то только это у меня на уме:
1. Речь идёт о том, что они могут умереть в любой момент, поэтому в конце их просто утешали.
2. Они искусственно созданные солдаты с помощью генной-инженерии, поэтому у них нет родителей. А она в конце крикнула: "Я буду хорошей мамой", что могло взять их за чувство, а директор якобы сказал, что для них это будет лучшим подарком, а они(пассажиры) не знают, что они искусственные.

Как говорилось в самом аниме, они могу умереть в любой момент... и не известно когда он наступит... 16-18 лет уже прожили, но сверх силы дают свое.

Ну судя по реакции на их лицах он сказал им про то, что они скоро умрут. "Мы будем ждать вас" было утешением.